總部位于深圳的華大生命科學(xué)研究院29日發(fā)布消息稱，由該院牽頭建設(shè)的基因組多維解析技術(shù)全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，聯(lián)合多家機(jī)構(gòu)共同開(kāi)發(fā)的名為Stereo-seq V2的創(chuàng)新技術(shù)成果，在8月28日登上國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》(Cell)。

　　據(jù)了解，臨床中超過(guò)90%的樣本是福爾馬林固定石蠟包埋樣本，其便于保存且數(shù)量龐大。這個(gè)巨大的樣本庫(kù)是一個(gè)無(wú)價(jià)的疾病“時(shí)間膠囊”寶庫(kù)，記錄了無(wú)數(shù)疾病發(fā)生、發(fā)展的完整過(guò)程。然而，福爾馬林這把“時(shí)間鎖”在固定的同時(shí)，也對(duì)組織內(nèi)的遺傳物質(zhì)，尤其是RNA，造成了嚴(yán)重的破壞。它的降解，就像一本珍貴的古籍被水浸泡后字跡模糊、書頁(yè)粘連，傳統(tǒng)技術(shù)難以有效讀取其中的信息。

Stereo-seq　V2應(yīng)用于不同保存年限的FFPE乳腺癌樣本。華大供圖

　　科研團(tuán)隊(duì)通過(guò)創(chuàng)新解交聯(lián)技術(shù)和隨機(jī)引物捕獲策略，突破這一核心瓶頸，意味著全球醫(yī)院病理科中積壓的福爾馬林固定石蠟包埋樣本庫(kù)，可被高效轉(zhuǎn)化為前沿研究的“數(shù)據(jù)源”，為臨床回顧性研究提供可能。

　　據(jù)悉，傳統(tǒng)技術(shù)在分析“宿主-微生物”時(shí)，或只能單獨(dú)看人體細(xì)胞，或需提前知道病原體種類才能設(shè)計(jì)探針檢測(cè)，如同“盲人摸象”。

　　該創(chuàng)新技術(shù)通過(guò)無(wú)偏捕獲樣本中人類基因和微生物RNA，實(shí)現(xiàn)“宿主-微生物原位共分析”，推動(dòng)生命科學(xué)研究從“看見(jiàn)細(xì)胞”邁向“看懂細(xì)胞與微生物戰(zhàn)場(chǎng)”的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)新時(shí)代。

　　科研團(tuán)隊(duì)介紹，在感染性疾病或腫瘤中，人體細(xì)胞與病原體、腫瘤細(xì)胞的互動(dòng)，就像一場(chǎng)復(fù)雜的戰(zhàn)爭(zhēng)。Stereo-seq V2能夠在不預(yù)設(shè)目標(biāo)的情況下，同時(shí)捕獲并定位樣本中所有人類基因和微生物的RNA。這相當(dāng)于為科學(xué)家提供了一張超高分辨率的“戰(zhàn)場(chǎng)實(shí)時(shí)地圖”，上面清晰地標(biāo)出了我方部隊(duì)(各類免疫細(xì)胞)的部署，以及敵軍(如結(jié)核桿菌)的藏身之處和活動(dòng)軌跡。

Stereo-seq　V2檢測(cè)結(jié)核桿菌感染小鼠肺臟的免疫動(dòng)態(tài)變化。華大供圖

　　值得一提的是，在抗體藥物研發(fā)方面，Stereo-seq V2助力研發(fā)團(tuán)隊(duì)快速找到并定位抗原特異性中和抗體克隆，可大幅提高抗體藥物的篩選效率，以推動(dòng)腫瘤和感染性疾病的精準(zhǔn)診療。

　　該成果的共同通訊作者、華大生命科學(xué)研究院博士李楊說(shuō)：“該技術(shù)作為‘生命數(shù)據(jù)引擎’，將驅(qū)動(dòng)基礎(chǔ)研究、臨床診斷和新藥研發(fā)進(jìn)入一個(gè)更加精準(zhǔn)、全面和原位的空間多組學(xué)時(shí)代?！?/p>